La Cromatografía de Exclusión por Tamaño (SEC) separa las moléculas según su tamaño, o más precisamente, su volumen hidrodinámico. Se basa en la discriminación de los componentes individuales de la muestra por los poros del material de empaque. Las moléculas de muestras grandes no pueden o sólo pueden penetrar parcialmente en los poros y eluir de la columna primero, mientras que las moléculas más pequeñas pueden acceder a todos o a un mayor número de poros y eluir después. La SEC es el único modo de cromatografía que no implica la interacción con una fase estacionaria por medio de la adsorción o la partición de los solutos.
Los términos SEC, GFC (cromatografía de filtración en gel) y GPC (cromatografía de permeación en gel) se refieren a la misma técnica cromatográfica. En el GFC se utiliza una fase móvil acuosa, mientras que en el GPC se emplea una fase móvil orgánica. El término general SEC abarca ambos usos.